MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 81527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	C	6	6	108	113	0 %	0 %	0 %	100 %	257057920
2	NC_013161	TAT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
3	NC_013161	TCAA	2	8	429	436	50 %	25 %	0 %	25 %	257057920
4	NC_013161	GGTC	2	8	469	476	0 %	25 %	50 %	25 %	257057920
5	NC_013161	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
6	NC_013161	G	7	7	557	563	0 %	0 %	100 %	0 %	257057920
7	NC_013161	T	6	6	636	641	0 %	100 %	0 %	0 %	257057920
8	NC_013161	TCG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
9	NC_013161	T	6	6	733	738	0 %	100 %	0 %	0 %	257057920
10	NC_013161	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057920
11	NC_013161	AAG	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
12	NC_013161	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
13	NC_013161	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057920
14	NC_013161	A	6	6	965	970	100 %	0 %	0 %	0 %	257057920
15	NC_013161	AT	3	6	1012	1017	50 %	50 %	0 %	0 %	257057920
16	NC_013161	ACTA	2	8	1022	1029	50 %	25 %	0 %	25 %	257057920
17	NC_013161	TCC	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057920
18	NC_013161	ACGG	2	8	1177	1184	25 %	0 %	50 %	25 %	257057920
19	NC_013161	ATCG	2	8	1204	1211	25 %	25 %	25 %	25 %	257057920
20	NC_013161	CGA	2	6	1232	1237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057920
21	NC_013161	GAGTT	2	10	1292	1301	20 %	40 %	40 %	0 %	257057920
22	NC_013161	GAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
23	NC_013161	TA	3	6	1350	1355	50 %	50 %	0 %	0 %	257057920
24	NC_013161	ATC	2	6	1916	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
25	NC_013161	A	6	6	1948	1953	100 %	0 %	0 %	0 %	257057921
26	NC_013161	ACAA	2	8	1959	1966	75 %	0 %	0 %	25 %	257057921
27	NC_013161	A	7	7	1978	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	257057921
28	NC_013161	AAT	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
29	NC_013161	CGT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
30	NC_013161	ATT	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
31	NC_013161	TTAA	2	8	2197	2204	50 %	50 %	0 %	0 %	257057921
32	NC_013161	TTG	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
33	NC_013161	AAAAT	2	10	2275	2284	80 %	20 %	0 %	0 %	257057921
34	NC_013161	AGC	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057921
35	NC_013161	GTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
36	NC_013161	AAT	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
37	NC_013161	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
38	NC_013161	GAA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057921
39	NC_013161	CAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
40	NC_013161	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
41	NC_013161	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
42	NC_013161	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
43	NC_013161	ATG	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057921
44	NC_013161	TTG	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
45	NC_013161	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	257057921
46	NC_013161	ATA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
47	NC_013161	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057921
48	NC_013161	CAAT	2	8	2799	2806	50 %	25 %	0 %	25 %	257057921
49	NC_013161	ACA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
50	NC_013161	CAAG	2	8	2907	2914	50 %	0 %	25 %	25 %	257057921
51	NC_013161	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	257057921
52	NC_013161	T	6	6	3073	3078	0 %	100 %	0 %	0 %	257057922
53	NC_013161	GGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057922
54	NC_013161	TTC	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
55	NC_013161	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
56	NC_013161	A	6	6	3246	3251	100 %	0 %	0 %	0 %	257057922
57	NC_013161	TA	3	6	3315	3320	50 %	50 %	0 %	0 %	257057922
58	NC_013161	CAAA	2	8	3359	3366	75 %	0 %	0 %	25 %	257057922
59	NC_013161	TGAT	2	8	3373	3380	25 %	50 %	25 %	0 %	257057922
60	NC_013161	CAAC	2	8	3405	3412	50 %	0 %	0 %	50 %	257057922
61	NC_013161	ATA	2	6	3428	3433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
62	NC_013161	TCCG	2	8	3440	3447	0 %	25 %	25 %	50 %	257057922
63	NC_013161	CCCA	2	8	3474	3481	25 %	0 %	0 %	75 %	257057922
64	NC_013161	ATA	2	6	3500	3505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
65	NC_013161	CTAGA	2	10	3515	3524	40 %	20 %	20 %	20 %	257057922
66	NC_013161	AAT	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
67	NC_013161	CCA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057922
68	NC_013161	TAA	2	6	3630	3635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
69	NC_013161	A	8	8	3744	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	257057922
70	NC_013161	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	257057922
71	NC_013161	TTC	2	6	3788	3793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
72	NC_013161	GTT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
73	NC_013161	TTG	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
74	NC_013161	AT	3	6	3946	3951	50 %	50 %	0 %	0 %	257057923
75	NC_013161	GTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
76	NC_013161	AGC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057923
77	NC_013161	TAA	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057923
78	NC_013161	AGT	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
79	NC_013161	TTA	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
80	NC_013161	ATT	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
81	NC_013161	CCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057924
82	NC_013161	CCT	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057924
83	NC_013161	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
84	NC_013161	T	6	6	4434	4439	0 %	100 %	0 %	0 %	257057924
85	NC_013161	TGT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057924
86	NC_013161	TTTA	2	8	4462	4469	25 %	75 %	0 %	0 %	257057924
87	NC_013161	TTA	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
88	NC_013161	TAA	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057924
89	NC_013161	AGG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057924
90	NC_013161	TTA	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
91	NC_013161	TTATT	2	10	4635	4644	20 %	80 %	0 %	0 %	257057924
92	NC_013161	TA	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	257057924
93	NC_013161	T	6	6	4661	4666	0 %	100 %	0 %	0 %	257057924
94	NC_013161	ATT	2	6	4668	4673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
95	NC_013161	TTTAGG	2	12	4750	4761	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257057924
96	NC_013161	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
97	NC_013161	TTGT	2	8	4833	4840	0 %	75 %	25 %	0 %	257057924
98	NC_013161	ATT	2	6	4876	4881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
99	NC_013161	TTG	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
100	NC_013161	CAT	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
101	NC_013161	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
102	NC_013161	T	6	6	5292	5297	0 %	100 %	0 %	0 %	257057925
103	NC_013161	TAAT	2	8	5313	5320	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
104	NC_013161	A	6	6	5392	5397	100 %	0 %	0 %	0 %	257057925
105	NC_013161	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
106	NC_013161	T	7	7	5451	5457	0 %	100 %	0 %	0 %	257057925
107	NC_013161	AACC	2	8	5465	5472	50 %	0 %	0 %	50 %	257057925
108	NC_013161	CAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057925
109	NC_013161	TTC	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
110	NC_013161	CTTGA	2	10	5617	5626	20 %	40 %	20 %	20 %	257057925
111	NC_013161	TA	3	6	5628	5633	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
112	NC_013161	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057925
113	NC_013161	AT	3	6	5847	5852	50 %	50 %	0 %	0 %	257057925
114	NC_013161	A	6	6	5886	5891	100 %	0 %	0 %	0 %	257057925
115	NC_013161	TTG	2	6	5959	5964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
116	NC_013161	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
117	NC_013161	CTT	2	6	5979	5984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
118	NC_013161	CA	3	6	6018	6023	50 %	0 %	0 %	50 %	257057925
119	NC_013161	TAA	3	9	6031	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
120	NC_013161	A	6	6	6078	6083	100 %	0 %	0 %	0 %	257057925
121	NC_013161	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
122	NC_013161	TGG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057925
123	NC_013161	T	6	6	6234	6239	0 %	100 %	0 %	0 %	257057925
124	NC_013161	AAT	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
125	NC_013161	ATT	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057926
126	NC_013161	TCT	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
127	NC_013161	T	6	6	6362	6367	0 %	100 %	0 %	0 %	257057926
128	NC_013161	CAAT	2	8	6393	6400	50 %	25 %	0 %	25 %	257057926
129	NC_013161	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
130	NC_013161	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
131	NC_013161	GCA	2	6	6540	6545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
132	NC_013161	TAA	2	6	6578	6583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
133	NC_013161	AATCA	2	10	6653	6662	60 %	20 %	0 %	20 %	257057926
134	NC_013161	T	6	6	6727	6732	0 %	100 %	0 %	0 %	257057926
135	NC_013161	ATC	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057926
136	NC_013161	AAT	2	6	6797	6802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
137	NC_013161	AGG	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
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139	NC_013161	GAC	3	9	6931	6939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
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141	NC_013161	AAGA	2	8	7134	7141	75 %	0 %	25 %	0 %	257057926
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157	NC_013161	GGT	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057926
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283	NC_013161	GAT	2	6	14747	14752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057933
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392	NC_013161	AAT	2	6	21028	21033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057939
393	NC_013161	A	7	7	21047	21053	100 %	0 %	0 %	0 %	257057940
394	NC_013161	TGT	2	6	21088	21093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057940
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397	NC_013161	AGA	2	6	21172	21177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057940
398	NC_013161	CA	3	6	21185	21190	50 %	0 %	0 %	50 %	257057940
399	NC_013161	ACT	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057940
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401	NC_013161	ATC	2	6	21237	21242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057940
402	NC_013161	GACA	2	8	21294	21301	50 %	0 %	25 %	25 %	257057940
403	NC_013161	AATT	2	8	21354	21361	50 %	50 %	0 %	0 %	257057940
404	NC_013161	GTT	2	6	21389	21394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057940
405	NC_013161	CTG	2	6	21411	21416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057940
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410	NC_013161	ACA	2	6	21796	21801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057940
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423	NC_013161	TTG	2	6	22398	22403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057941
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430	NC_013161	TAT	2	6	22586	22591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057941
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432	NC_013161	G	6	6	22639	22644	0 %	0 %	100 %	0 %	257057941
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459	NC_013161	AATG	2	8	23965	23972	50 %	25 %	25 %	0 %	257057942
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500	NC_013161	GAC	3	9	26212	26220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057944

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